{"id":13754,"date":"2021-01-21T17:15:44","date_gmt":"2021-01-21T20:15:44","guid":{"rendered":"https:\/\/jornalfatosenoticias.com.br\/?p=13754"},"modified":"2021-01-21T17:15:49","modified_gmt":"2021-01-21T20:15:49","slug":"algoritmo-consegue-diferenciar-celulas-cancerosas-das-saudaveis-pelo-rna","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/jornalfatosenoticias.com.br\/index.php\/2021\/01\/21\/algoritmo-consegue-diferenciar-celulas-cancerosas-das-saudaveis-pelo-rna\/","title":{"rendered":"Algoritmo consegue diferenciar c\u00e9lulas cancerosas das saud\u00e1veis pelo RNA"},"content":{"rendered":"\n

Cientistas da Universidade do Texas desenvolveram uma nova t\u00e9cnica computacional que consegue para diferenciar, com precis\u00e3o quase absoluta, c\u00e9lulas cancerosas das saud\u00e1veis por meio da\u00a0an\u00e1lise de sequenciamento<\/a>\u00a0de RNA. O trabalho foi\u00a0publicado na\u00a0Nature Biotechnology<\/em><\/a>\u00a0e a ferramenta est\u00e1\u00a0dispon\u00edvel gratuitamente<\/a>.
Chamado de CopyKAT, o sistema permite a an\u00e1lise r\u00e1pida de grandes conjuntos de dados de sequenciamento<\/a>\u00a0de RNA retirados de uma \u00fanica c\u00e9lula. Essas cadeias de prote\u00ednas fornecem dados de express\u00e3o g\u00eanica de muitos milhares de c\u00e9lulas individuais, nas quais os cientistas podem procurar por cromossomos anormais, comuns na\u00a0maioria dos tumores<\/a>.
\u201cDesenvolvemos o CopyKAT como uma ferramenta para inferir informa\u00e7\u00f5es gen\u00e9ticas a partir dos dados do transcriptoma\u201d, explica Nicholas Navin, professor de Gen\u00e9tica e Biologia Computacional da Universidade do Texas. Foram analisadas 46.501 c\u00e9lulas \u00fanicas de 21 tumores, incluindo c\u00e2ncer de mama triplo-negativo<\/a>, adenocarcinoma ductal pancre\u00e1tico, c\u00e2ncer anapl\u00e1sico de tireoide, carcinoma ductal invasivo e glioblastoma.
\u201cAo aplicar essa ferramenta a v\u00e1rios conjuntos de dados, mostramos que pod\u00edamos identificar, com cerca de 99% de precis\u00e3o, c\u00e9lulas tumorais em meio a outras c\u00e9lulas imunol\u00f3gicas ou estromais presentes em uma amostra de tumor mista\u201d, conta Navin.
A ferramenta tamb\u00e9m ajuda a identificar subpopula\u00e7\u00f5es distintas, ou clones, dentro das c\u00e9lulas cancerosas. \u201cPoderemos ent\u00e3o dar um passo adiante, e entender as diferen\u00e7as gen\u00e9ticas entre os subclones presentes\u201d, completa o pesquisador.<\/p>\n\n\n\n

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Ao examinar a express\u00e3o do gene de cada c\u00e9lula individual, pesquisadores puderam desenvolver uma imagem da paisagem do tumor, incluindo o microambiente circundante (Foyo: CI Photos\/Shutterstock)<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Historicamente, os tumores t\u00eam sido estudados como uma mistura de todas as c\u00e9lulas presentes, muitas das quais n\u00e3o s\u00e3o cancerosas. Por meio do sequenciamento de RNA, cientistas puderam analisar tumores em uma resolu\u00e7\u00e3o muito maior. Por\u00e9m, ainda havia o desafio de distinguir entre c\u00e9lulas cancerosas e c\u00e9lulas normais.
Os algoritmos do CopyKAT aprimoram t\u00e9cnicas computacionais mais antigas, aumentando a precis\u00e3o e ajustando a an\u00e1lise para a mais nova gera\u00e7\u00e3o de dados de sequenciamento de RNA. \u201cFomos capazes de identificar subpopula\u00e7\u00f5es raras em c\u00e2nceres de mama triplo-negativos que t\u00eam altera\u00e7\u00f5es gen\u00e9ticas \u00fanicas\u201d, lembra a professora assistente de Ci\u00eancias Cardiovasculares, Ruli Gao, que desenvolveu os algoritmos do sistema.
\u201cEsperamos que esta ferramenta seja \u00fatil para a comunidade de pesquisa para aproveitar ao m\u00e1ximo seus dados de sequenciamento de RNA de uma \u00fanica c\u00e9lula e para conduzir novas descobertas no c\u00e2ncer\u201d, completa a pesquisadora.<\/p>\n\n\n\n

Fonte: Olhar Digital<\/a><\/em><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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